طبق منطقه بندی که توسط دفتر هماهنگی امور استان‌ها صورت گرفت سازمان‌های جهاد کشاورزی در پنج منطقه قرار گرفتند.
سازمان جهاد کشاورزی استان فارس، همراه با استان‌های بوشهر، چهارمحال و بختیاری، خوزستان، کهگیلویه و بویراحمد و هرمزگان در منطقه دو قرار گرفت که با انتخابات صورت گرفته رئیس سازمان جهاد کشاورزی استان فارس به عنوان رئیس منطقه دو کشور انتخاب شد.
رئیس هر منطقه؛ وظایفی از جمله پیگیری تشکیل جلسات مستمر به منظور بررسی مسائل و مشکلات استان‌های آن منطقه و همفکری، تبادل اطلاعات و انعکاس مسائل و مشکلات مربوطه به مدیر کل هماهنگی امور استان‌ها، معاونین وزیر و مقام عالی وزارت را برعهده دارد.
